距离上次「巫女」与「妖怪之王」之间的对决已经过去数百年,随着妖怪之王的封印与巫女的死去,如今妖怪已经早已不再出现在世人面前,而过去那些唯一能与妖怪抗衡,能够使用特殊法术的人们,也将他们的力量展现在名为「神武祭」的新型比赛上,并宛如明星一般以选手的身分相互较劲。

然而,妖怪之王并非死亡。随着封印的逐渐弱化,躲藏于山林之中的妖怪们也开始躁动。

与此同时,身为这个时代的巫女,名为凛音的少女,也与自己的女仆一同转学到了专门培养选手的学校里就读。在这里认识新的伙伴与恋人的同时,凛音也将努力与妖怪们战斗,并逐渐了解到关于巫女的秘密。